Na terceira temporada, no resto dos Episodios, os irmãos Winchester continuam caçando e Dean vive a sua vida loucamente.Aparece um demonio chamado Ruby que os ajuda varias vezes ate ao final da temporada. Porém eles não sabem que por trás de tudo existe uma força demoníaca maior chamada Lilith e que fará o possível para acabar com Sam. No final dessa temporada, o prazo do pacto de Dean se esgota, resultando em sua morte, que ocorre de forma brutal. Nos momentos finais, Dean aparece agonizando no inferno, acorrentado, clamando por ajuda.